Preguntas de Examen de Bioquímica Clínica. Bloque 11) De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA.La propensión de las moléculas de agua a formar enlaces de hidrógeno una con otra es el factor primario del cual dependen todas las propiedades del agua que siguen, EXCEPTO: Su punto de ebullición atípicamente alto. Su calor de vaporización alto. Su tensión superficial alta. Su capacidad para disolver hidrocarburos. Su expansión en el momento de la congelación.Resultado: 2) De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA. Las cadenas laterales de los aminoácidos cisteína y metionina absorben luz a 280 nm. La glicina a menudo está presente en regiones donde un polipéptido forma una flexión aguda, lo cual revierte la dirección de un polipéptido. Los polipéptidos se nombran como derivados del residuo aminoacilo C terminal. Los átomos de C, N, O y H de un enlace peptídico son coplanares. Un pentapéptido lineal contiene cuatro enlaces peptídicos.Resultado: 3) De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA. Los amortiguadores del tejido humano son bicarbonato, proteínas y ortofosfato. Un ácido débil o una base débil muestra su mayor capacidad de amortiguación cuando el pH es igual a su pKa más o menos una unidad de pH. El pH isoeléctrico (pI) de la lisina puede calcularse al usar la fórmula (pK2 1 pK3)/2. La movilidad de un ácido débil monofuncional en un campo eléctrico de corriente continua alcanza su máximo cuando el pH de su ambiente circundante es igual a su pKa. En aras de la sencillez, las potencias de las bases débiles por lo general se expresan como la pKa de sus ácidos conjugados.Resultado: 4) De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA. Si la pKa de un ácido débil es de 4.0, 50% de las moléculas estará en el estado disociado cuando el pH del ambiente circundante es de 4.0. Un ácido débil con una pKa de 4.0 será un amortiguador más eficaz a pH de 3.8 que a pH de 5.7. A un pH igual a su pI, un polipéptido no porta grupos cargados. Los ácidos y bases fuertes se denominan así porque se disocian por completo cuando se disuelven en agua. La pKa de un grupo ionizable puede estar influida por las propiedades físicas y químicas de su ambiente circundante.Resultado: 5) De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA. Un objetivo importante de la proteómica es identificar todas las proteínas presentes en una célula bajo diferentes condiciones, así como sus estados de modificación. La espectrometría de masa ha reemplazado en su mayor parte al método de Edman para la secuenciación de péptidos y proteínas. El reactivo de Sanger fue una mejoría del método de Edman porque el primero genera un amino terminal nuevo, lo que permite que tengan lugar varios ciclos de secuenciación consecutivos. Dado que la masa es una propiedad universal de todos los átomos y moléculas, la espectrometría de masa es ideal para la detección de modificaciones postraduccionales en proteínas. Los espectrómetros de masa de tiempo de vuelo aprovechan la relación F 5 ma.Resultado: 6) De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA. La cromatografía de intercambio iónico separa proteínas con base en el signo y la magnitud de su carga a un pH dado. La electroforesis en gel bidimensional separa proteínas primero con base en sus valores de pI, y en segundo lugar con base en su proporción entre carga y masa con el uso de SDS-PAGE. La cromatografía de afinidad explota la selectividad de interacciones entre proteína y ligando para aislar una proteína específica de una mezcla compleja. Muchas proteínas recombinantes se expresan con un dominio adicional fusionado a su N terminal o C terminal. Un componente común de estos dominios de fusión es un sitio de unión a ligando diseñado expresamente para facilitar la purificación mediante cromatografía de afinidad. Después de purificación mediante técnicas clásicas, la espectrometría de masa en tándem típicamente se usa para analizar péptidos homogéneos individuales derivados de una mezcla de proteínas compleja.Resultado: 7) De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA. El plegamiento de proteína es asistido por la intervención de proteínas auxiliares especializadas llamadas chaperones. El plegamiento de proteína tiende a ser modular; primero se forman áreas de estructura secundaria local, y después coalescen hacia un glóbulo fundido. El plegamiento de proteína es impulsado en primer lugar por la termodinámica de las moléculas de agua que rodean al polipéptido naciente. La formación de enlaces S-S en una proteína madura es facilitada por la enzima proteína disulfuro isomerasa. Sólo algunas proteínas poco comunes, como el colágeno, requieren procesamiento postraduccional mediante proteólisis parcial para alcanzar su conformación madura.Resultado: 8) De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA. Las modificaciones postraduccionales de proteínas pueden afectar tanto su función como su destino metabólico. El estado conformacional natural generalmente es el que es favorecido desde el punto de vista termodinámico. Las estructuras tridimensionales complejas de casi todas las proteínas se forman y se estabilizan por los efectos acumulativos de un gran número de interacciones débiles. Los científicos investigadores emplean chips génicos para la detección, con alta capacidad de procesamiento, de la presencia de proteínas y la magnitud de expresión de las mismas. Los ejemplos de interacciones débiles que estabilizan el plegamiento de proteína incluyen enlaces de hidrógeno, puentes salinos, y fuerzas de Van der Waals.Resultado: 9) De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA. Los cambios de configuración comprenden la rotura de enlaces covalentes. Los cambios de conformación comprenden la rotación de uno o más enlaces únicos. El gráfico de Ramachandran ilustra el grado al cual el impedimento estérico limita los ángulos permisibles de los enlaces únicos en el esqueleto de un péptido o una proteína. La formación de una hélice α es estabilizada por los enlaces de hidrógeno entre cada péptido unido a oxígeno carboxilo y el grupo N-H del siguiente enlace peptídico. En una lámina β, los grupos R de residuos adyacentes apuntan en direcciones opuestas respecto al plano de la lámina.Resultado: 10) De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA. El descriptor α2 β2 g 3 denota una proteína con siete subunidades de tres tipos diferentes. Los bucles son regiones extendidas que conectan regiones de estructura secundaria adyacentes. Más de la mitad de los residuos en una proteína típica reside en hélices α o hojas β. Casi todas las hojas β tienen un giro diestro. Los priones son virus que causan enfermedades del plegamiento de proteína que atacan el cerebro.Resultado: 11) Un ingeniero de proteína desea alterar el sitio activo de la quimotripsina de modo que divida enlaces peptídicos para el lado C terminal de residuos de aspartilo y glutamilo. El ingeniero de proteína tendrá más probabilidades de tener éxito si reemplaza el aminoácido hidrofóbico en la parte inferior de la bolsa del sitio activo con: Fenilalanina. Treonina. Glutamina. Lisina. Prolina.Resultado: 12) De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA: Muchas proteínas mitocondriales son modificadas de manera covalente por la acetilación de los grupos e-amino de residuos de lisina. La acetilación de proteína es un ejemplo de una modificación covalente que puede “revertirse” en condiciones fisiológicas. La concentración aumentada de acetil-coa tiende a favorecer la acetilación de proteína. La acetilación aumenta la masa estérica de las cadenas laterales de aminoácido que están sujetas a esta modificación. La cadena lateral de un residuo de lisilo acetilado es una base más fuerte que la de un residuo de lisilo no modificado.Resultado: 13) De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA: La catálisis acidobásica es una característica prominente del mecanismo catalítico de la proteasa de HIV. El modelo de cerradura y llave de Fischer explica el papel de la estabilización del estado de transición en la catálisis enzimática. La hidrólisis de enlaces peptídicos por serina proteasas comprende la formación transitoria de una enzima modificada. Muchas enzimas emplean iones metálicos como grupos prostéticos o cofactores. En general, las enzimas se unen a análogos de estado de transición más estrechamente que a análogos de sustrato.Resultado: 14) De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA: Para calcular la Keq, la constante de equilibrio para una reacción, se divide la tasa inicial de reacción hacia adelante (tasa 1 ) por la velocidad inicial de la reacción reversa (tasa 21 ). La presencia de una enzima no tiene efectos sobre la Keq. Para una reacción conducida a temperatura constante, la fracción de las moléculas de reactante potenciales que poseen suficiente energía cinética para exceder la energía de activación de la reacción es una constante. Las enzimas y otros catalíticos disminuyen la energía de activación de reacciones. El signo algebraico de ΔG, el cambio de energía libre de Gibbs para una reacción, indica la dirección en la cual procederá una reacción.Resultado: 15) De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA: Como se usa en bioquímica, la concentración de estado estándar para productos y reactantes que no son protones es 1 molar. ΔG es una función del logaritmo de Keq. Como se usa en cinética de reacción, el término “espontaneidad” se refiere al hecho de si la reacción como está escrita es favorecida para que proceda de izquierda a derecha. ΔG° denota un cambio de la energía libre que acompaña la transición desde el estado estándar hacia el equilibrio. En el momento en que se alcanza equilibrio, las tasas de la reacción hacia adelante y reversa disminuyen a cero.Resultado: 16) De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA: Las enzimas disminuyen la energía de activación para una reacción. Otro medio mediante el cual las enzimas disminuyen la energía de activación es al desestabilizar intermediarios de estado de transición. Los residuos histidilo de sitio activo a menudo ayudan a la catálisis al actuar como donadores de protones o como aceptores de los mismos. Algunas enzimas emplean catálisis covalente para proporcionar una vía de reacción única. La presencia de una enzima no tiene efectos sobre el ΔG°.Resultado: 17) De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA: Para casi todas las enzimas, la relación de [S] y la tasa de reacción inicial, vi, da una curva hiperbólica. Cuando [S] es mucho más bajo que Km, el término Km + [S] en la ecuación de Michaelis-Menten se aproxima mucho a Km. En estas condiciones, la tasa de catálisis es una función lineal de [S]. Las concentraciones molares de sustrato y productos son iguales cuando la tasa de una reacción catalizada por enzima alcanza la mitad de su máximo potencial (Vmáx/2). Se dice que una enzima ha quedado saturada con sustrato cuando el aumento sucesivo de [S] no produce un incremento importante de vi. Cuando se hacen mediciones de tasa de estado estable, la concentración de sustratos debe exceder mucho la del catalítico enzimático.Resultado: 18) De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA: Ciertas enzimas monoméricas muestran cinética de tasa inicial sigmoidea. La ecuación de Hill se usa para realizar análisis cuantitativo de conducta cooperativa de enzimas o proteínas de transporte, como hemoglobina o calmodulina. Para una enzima que muestra unión cooperativa de sustrato, se dice que un valor de n (el coeficiente de Hill) de más de la unidad muestra cooperatividad positiva. Se dice que una enzima que cataliza una reacción entre dos o más sustratos opera mediante un mecanismo secuencial si los sustratos deben unirse en un orden fijo. Los grupos prostéticos permiten a las enzimas añadir capacidades más allá de las proporcionadas por cadenas laterales de aminoácidos.Resultado: 19) De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA: IC50 es un término operacional sencillo para expresar la potencia de un inhibidor. En los gráficos de Lineweaver-Burk y de Dixon se emplean versiones reordenadas de la ecuación de Michaelis-Menten para generar representaciones lineales de conducta e inhibición cinéticas. Un gráfico de 1/vi en contraposición con 1/[S] puede usarse para evaluar el tipo de un inhibidor y la magnitud del mismo. Los inhibidores simples no competitivos disminuyen la Km aparente para un sustrato. Los inhibidores no competitivos típicamente tienen poca o ninguna semejanza estructural con el o los sustratos de una reacción catalizada por enzima.Resultado: 20) De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA: Para una enzima dada, las concentraciones intracelulares de sus sustratos tienden a estar cerca de sus valores de Km. El secuestro de ciertas vías dentro de orgánulos intracelulares facilita la tarea de la regulación metabólica. El paso más temprano en una vía bioquímica en la cual puede ejercerse con eficiencia control regulador es el primer paso comprometido. Regulación por retroacción se refiere al control alostérico de un paso temprano en una vía bioquímica por el o los productos finales de esa vía. El control metabólico es más eficaz cuando uno de los pasos rápidos en una vía es establecido como objetivo para regulación.Resultado: 21) De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA: El efecto Bohr se refiere a la liberación de protones que ocurre cuando el oxígeno se une a la desoxihemoglobina. Poco después del nacimiento de un lactante humano, hay inducción rápida de la síntesis de la cadena a hasta que comprende 50% del tetrámero de hemoglobina. La cadena β de hemoglobina fetal está presente durante toda la gestación. El término talasemia se refiere a cualquier defecto genético que da por resultado falta total o parcial de las cadenas α o β de la hemoglobina. La conformación tensa de la hemoglobina es estabilizada por varios puentes de sal que se forman entre las subunidades.Resultado: 22) De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA: El obstáculo estérico por la histidina E7 desempeña un papel crucial en la debilitación de la afinidad de la hemoglobina por el monóxido de carbono (CO). La anhidrasa carbónica desempeña un papel crucial en la respiración en virtud de su capacidad para desintegrar 2,3-difosfoglicerato en los pulmones. La hemoglobina S se distingue por una mutación genética que sustituye Glu6 en la subunidad β por Val, lo cual crea un parche pegajoso sobre su superficie. La oxidación del hierro hem del estado 12 al estado 13 suprime la capacidad de la hemoglobina para unirse al oxígeno. Las diferencias funcionales entre la hemoglobina y la mioglobina reflejan, en un alto grado, diferencias de su estructura cuaternaria.Resultado: 23) De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA: La red de transmisión de carga de la tripsina hace que el sitio activo de la serina sea un nucleófilo más potente. La constante de Michaelis es la concentración de sustrato a la cual la tasa de la reacción es de la mitad del máximo. Durante reacciones de transaminación, ambos sustratos están unidos a la enzima antes de que se libere cualquier producto. Los residuos de histidina actúan como ácidos y como bases durante la catálisis por una aspartato proteasa. Muchas coenzimas y cofactores se derivan de vitaminas.Resultado: 24) De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA: Las enzimas interconvertibles desempeñan funciones clave en redes reguladoras integradas. La fosforilación de una enzima a menudo altera su eficiencia catalítica. Los “segundos mensajeros” actúan como extensiones intracelulares o sustitutos para hormonas e impulsos nerviosos que inciden sobre receptores de superficie celular. La capacidad de proteína cinasas para catalizar la reacción reversa que elimina el grupo fosforilo es clave para la versatilidad de este mecanismo regulador molecular. La activación de zimógeno por proteólisis parcial es irreversible en condiciones fisiológicas.Resultado: 25) De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA: La HapMap Database se enfoca en la localización e identidad de polimorfismos de un solo nucleótido en seres humanos. Genbank es un depósito de datos sobre los resultados fenotípicos de deleciones (knockout) de gen en seres humanos. La Protein Database o PDB almacena las estructuras tridimensionales de proteínas según se determina mediante cristalografía de rayos X o espectroscopia por resonancia magnética nuclear (NMR). El objetivo del proyecto ENCODE es identificar todos los elementos funcionales del genoma. BLAST compara secuencias de proteína y de nucleótido para identificar áreas de similitud.Resultado: 26) De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA: Un obstáculo importante en el diseño de fármacos auxiliado por computadora son las extraordinarias demandas de capacidad de cómputo requeridas para permitir a las proteínas y ligandos que tengan un grado realista de flexibilidad conformacional. La flexibilidad conformacional se necesita para permitir que el ligando y la proteína influyan uno sobre el otro como se describe mediante modelos de cerradura y llave para la unión entre proteína y ligando. La construcción de una célula virtual podría proporcionar un medio para detectar con rapidez y eficiencia muchos efectos indeseables de fármacos potenciales, sin la necesidad de pruebas de laboratorio costosas. La biología de sistemas pone de relieve la manera en la cual las conexiones entre componentes enzimáticos u otros componentes en una célula afectan su desempeño. Los biólogos de sistemas a menudo emplean la lógica simbólica de los programas de computadora y los circuitos electrónicos para describir las interacciones entre proteínas, genes y metabolitos.Resultado: 27) De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA: Las representaciones GRASP ponen de relieve áreas de la superficie de una proteína que poseen carácter positivo o negativo local. Las simulaciones de dinámica molecular buscan reconstruir los tipos de movimiento y el rango de este último por los cuales pasan las proteínas flexibles desde el punto de vista conformacional. Los investigadores usan programas de esfera giratoria para localizar indentaciones y hendeduras sobre la superficie de una proteína, porque éstas representan sitios probables para el ataque por proteasas. Para adaptarse al poder de cómputo disponible, las simulaciones de acoplamiento molecular a menudo restringen la rotación libre a sólo un pequeño grupo de enlaces en un ligando. Discernir las relaciones evolutivas entre proteínas constituye uno de los medios más eficaces de predecir las funciones probables de un polipéptido recién descubierto.Resultado: ExámenesSiguientePreguntas de Examen de Bioquímica Clínica. Bloque 2